而按照1986年《生乳收购标准》(即老国标)规定，最优级别生乳的细菌总数不得超过50万个/毫升，蛋白质最低值为2.95克/百克。从这两项指标来看，新国标对生乳采购的标准不升反降，反而不如25年前制定的标准，这也成为广州市奶业协会理事长王丁棉质疑新国标的主要依据。
“经过25年的发展，乳业科技水平提高了，人们生活水平也比以前好了，怎么能把标准降到如此低呢？”中国农业大学博士生导师、中国乳业协会常务理事南庆贤表示，世界上所有的乳业大国，生乳蛋白质含量标准都至少在3.0%以上；而菌落总数，美国、欧盟是10万个/毫升，丹麦是3万个/毫升，新国标将我国和发达国家的标准拉得更开。”
对此，农业部食品质量监督检验测试中心(上海)、乳品安全标准工作专家组成员孟瑾反驳道，1986年的老国标将菌落总数分为四个等级，Ⅰ级低于50万CFU(菌落形成单位)毫升，Ⅱ级低于100万，Ⅲ级低于200万，Ⅳ低于400万，“新国标将400万个/毫升调整为200万个/毫升，不能说是倒退，应该说是要求更严格了。”
至于新国标为何将生乳蛋白质收购的最低标准降低了0.15%，那达木德表示，如果执行更高标准，7成奶农将杀牛。他解释说：“大家都希望对乳品的质量高标准、严要求。但是，如果制定一个标准，大部分生产者都达不到，就有些脱离实际情况了。”
目前我国奶牛养殖业的实际情况是：小规模散养比例较高，超过70%；100头以上规模，不到30%。由于不是标准化养殖，奶农经常是自家种什么，就给奶牛吃什么，因此生乳的蛋白质含量不稳定。
通常，在5月下旬至8月下旬3个月的泌乳期内，相当一部分生乳蛋白质含量低于2.95%。据农业部调查，2007年和2008年夏季，北方一些省份生乳的蛋白质含量低于2.95克/百克的比例分别达75%和90%；某乳品企业6月份西北、中南、东北等三个区收购生乳的蛋白质含量低于2.95克/百克的比例分别达75.8%、33.8%和24.9%。
然而，对于新国标是为了照顾中小奶农的利益这一说法，王丁棉并不认同。他表示，新标准实施一年了，奶农并没有从中得到很大实惠。按说国内的乳品需求增长很快，但是一些地方却出现了奶农倒奶、杀牛的情况。有的地方一斤原奶价格掉到1.2元，甚至还有8毛钱的，连饲料和人工成本都不够。如果销路好，获利丰厚，奶农怎么可能轻易退出呢？
奶农没获利，国内消费者也不买账。王丁棉表示，现在很多人都在想尽一切办法买国外的乳制品，在国内不惜高价买、出国大包小包带、冒着不辨真假的风险网上代购，这些都充分显示了老百姓对国产乳品的消费信心下降。王丁棉认为，降低标准，获利的是乳品企业。饲养成本降低，企业比较容易收购低价奶源，有条件以更低价格占领市场。
生乳标准不等于乳制品标准
“许多人混淆了原料标准和产品标准两个概念。”西部乳业发展协作会秘书长、西安市乳业协会秘书长王伟民表示：“新国标是由70多个专家经过充分调研、慎重考虑、严密论证而最终制定出的，是规范乳制品行业发展、保护消费者食品安全和维护数百万奶农利益均衡协调的产物。”
“目前的新国标之争更多地源于公众因误解而产生的恐慌。”科普作家方舟子认为，不应夸大巴氏奶和常温奶的区别而妖魔化常温奶，也不能因为生乳标准的下降就危言耸听，误导和吓唬消费者，“让多少人以为那200万细菌是要活活喝下去呢！”
“生乳作为原料乳，消费者不会直接饮用，生产企业使用其生产产品时要经过杀菌等工艺，达到乳制品产品国家标准规定后方可上市销售。”孟瑾表示。
内蒙古奶业协会理事、内蒙古大学生命科学院生物系教授薛孝先指出：“细菌总数所对应的是生乳，并不是消费者购买的乳制品成品。国内乳制品在生产过程中，原奶都是经过超高温灭菌，不存在原奶直接入口的问题，最终制成的奶制品也完全符合食品安全标准。”
薛孝先也认为，无须担心蛋白质含量下降会影响到牛奶的营养价值，喝牛奶不是为了补充蛋白质，而主要是为了补充B族维生素和钙等无机质。
方舟子表示，蛋白质是一种必需营养素，我们每天都必需补充它。一个体重60公斤的人一天需要的优质蛋白质为48克，人们可以从食物中获得，一个鸡蛋就含有大约6克优质蛋白质。与此相比，牛奶少掉的那0.15%的蛋白质是可以忽略的。
许多企业已执行更高标准
对于王丁棉抨击新国标全球最差的言论，一位乳业内部人士表示十分不解：“日本的国家标准是生乳中的菌落总数低于400万个/毫升，菲律宾没有国家标准。而且日本国家标准虽然是菌落总数低于400万个/毫升，但企业的标准都很严格，收奶时的标准是1万个/毫升左右。”
“国标是一回事，我们企业自己怎么做是另外一回事。”记者在采访时发现，许多企业表示其实对新国标并不在乎，新国标制定的只是行业“最低标准”，是一个奶源收购合格的“入门门槛”，企业都有自己的严格标准，甚至比发达国家乳品企业的还严格。
据资料显示，三元绿荷奶牛养殖中心2007年牛奶总细菌数就已经控制在10万个/毫升以下，福建长富2010年全年奶源细菌数的平均数仅为7.95万个/毫升，这远高于200万个/毫升的国家标准。上海奶业协会副秘书长曹明是表示，如今上海地区生乳平均细菌数为每毫升5.6万个，不少地区乳企执行的标准甚至都不逊色于海外乳业标准。
东方艾格农业咨询公司乳业资深专家陈莲芳介绍，乳企在收购奶源时大多会分等级采购，不同的蛋白质含量和卫生指标，按不同价格收购；收购回来后，也按所生产产品需求来分配，比如若是按新国标收来的奶源，只能做常温奶、冷饮等产品，而蛋白质高、细菌总数低的优质奶源则用之做高端奶如酸奶、奶酪等。
