联邦食品、药品和化妆品法的一个基本目的是保护公众使其不受有毒或有害的、不洁的或腐烂的、或在不卫生条件下生产的、可能遭到污染的、或对健康有害的产品的伤害.
《联邦食品、药品和化妆品法》对卫生的要求还规定禁止出售带有病毒的产品, 并要求食品必须在卫生设施中生产.
该法禁止销售由于不洁贮藏条件而直引起的含有令人厌恶的或污物的食品,而不管该事实上是否含有污物.污物包括鼠类和其它动物的毛发和泄物、整只昆虫、昆虫的一个部分和昆虫排泄物,
寄生虫、人类和动物排泄物引起的污染,以及被不知情者食用或使用的其它异物(由于其脏污).含有这类污物的食品,无论是否已表现出对健康有害,均被视为伪劣食品.

因此,《联邦食品、药品和化妆品法》要求在食品店的所有生产阶段都不得被污染.这类保护包括要求食品中不可混入动物和昆虫;对原料进行检查和分类,以除其腐烂变质的成分;快速装运和贮藏以防止食品污染和变质;使用清洁的设备;
控制可能出现的污水污染源; 对食品制作人员进行监督以防止在食品处理过程中不卫生而引起的污染.
在装运前未被污染的食品有时在运输途中会被弄脏,因此必须被扣留或没收,这就强调了在船上、铁路车辆内及其它承运工具中必须保证贮藏条件完好的重要性,
尽管可以指责发货人,但法律要求对非法商品采取行动,无论商品是在哪里开始变成非法的,所有发货人都必须包装其产品,使产品在途中不损坏、不污染,
并且必须敦促承运人员通过保持卫生条件和将食品与其它可能引起污染的食品分隔开来保护商品.例如,运送食品的船只也可能装运矿石和有毒杀虫剂.
货物装卸不当或发生海上灾害时会使装载的货物发生严重污染,从而需要扣留被污染的物品.
在进口货物入关和登陆后受到污染的情况下 (例如卡车事故、火灾、平底船沉没),不是按法律的进口货物规定对此采取法律行动,
而是按在美国国内各州间运送货物的规定联邦政府的地区法庭予以没收.
对已被害虫污染的商品进行熏蒸消毒不能使该商品成为合法产品,
因为死虫或过去害虫污染的证据是令人厌恶的.在必要时可用熏蒸消毒法防止蔓延,但必须注意防止因熏蒸消毒引起的化学残留物